Khu công nghiệp Bá Thiện II được phê duyệt bổ sung vào quy hoạch các khu công nghiệp tại Việt Nam theo Công văn số 1821/TTg-CN ngày 26/11/2007 của Thủ tướng Chính phủ với diện tích quy hoạch dự kiến là 350 ha. Ngày 06/11/2008, Khu công nghiệp Bá Thiện II được phê duyệt quy hoạch chi tiết tỷ lệ 1/2000 tại Quyết định số 4045/QĐ-UBND của UBND tỉnh Vĩnh Phúc.
Ngày 27/02/2009, Ban quản lý các KCN tỉnh Vĩnh Phúc đã cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư số 19202200141 cho Công ty TNHH Vina – CPK làm chủ đầu tư Dự án đầu tư và kinh doanh hạ tầng kỹ thuật khu công nghiệp Bá Thiện II vơi số vốn đầu tư hơn 1083 tỷ đồng, dự án có thời hạn hoạt động là 49 năm kể từ ngày cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư.
Sau nhiều lần điều chỉnh quy hoạch chi tiết tại các Quyết định số 2475/QĐ-UBND ngày 03/10/2012; Quyết định số 2154/QĐ-UBND ngày 11/08/2014; Quyết định số 2781/QĐ-UBND ngày 07/11/2018, khu công nghiệp Bá Thiện II chính thức được thành lập theo Quyết định số 1625/QĐ-UBND ngày 02/07/2019 của UBND tỉnh Vĩnh Phúc với diện tích quy hoạch là 308,83 ha, có vị trí quy hoạch thuộc địa giới hành chính các xã Bá Hiến, Thiện Kế và xã Trung Mỹ, huyện Bình Xuyên, tỉnh Vĩnh P